ключ на 5-6 ампер, выдержит такой ключ моторчик или нет?
Если лепить типовую защиту на каждую банку, проблема обычно в другом -- защита не заточена на токи типичные для моделей и обрубает питание при вполне допустимых токах и напряжении.
В фабричные литиевые батареи, в т.ч. для моделей, никогда не ставят автономные защиту на каждую банку.
Есть банки 18650, но без защиты
Для сборки батарей из лития защищенные и не нужны.
Если банки нормальные, а не ноутбучная отработка или с алиэкспресса -- делайте нормальную батарею, собирайте нужную конфигурацию контактной сваркой.
Понадобится еще зарядка для лития и, скорее всего, плата защиты. В модельках, если хочется попроще, обычно не переделывают электронику под литий. Учитывая, что ток потребления моделек приличный и импульсный, типовая защита вполне нормально отрабатывает по минимальному напряжению, обычно даже с запасом, немного раньше, чем аккумы разрядятся до разрешенного минимума.