Мега 48 не содержит в себе аппаратной поддержки USB. Это значит, что весьма значительную часть времени МК придется заниматься программной обработкой сигналов на шине, их анализу и всему прочему. Более того, в этом случае Вам придется досконально изучить, то же там происходит, на шине, а копипастить Вы не желаете

Мне пришлось изучать данный вопрос, не могу сказать, что это легко и непринужденно понимаетс. Тем более с моим английским. А на русском я не нашел инфы. Мой вывод - все-таки предпочтительнее использовать МК с аппаратной поддержкой USB.
Далее, неплохо бы узнать, что может предложить интернет на предмет программной поддержки выбранного диапазона МК. Увы, мне так же не попадалось ничего для AVRов. Зато микрочип просто сияет свой бесплатной поделкой. В корой очень много чего интересного уже написано. Худо-бедно, но это работает. Вполне доступно для понимания (после пары недель вкуривания) и все такое. Мой вывод - берем то, что имеет программную поддержку нашей задумки.
Опять же, вопрос о программной подержке со стороны ПК. Если Вы сможете написать драйвер и все прочее, да чтоб оно еще и работало как надо - респект. Я не способен на такой подвиг. Поэтому выбрал уже готовенькое

Далее смотрим, как все это соотносится с нашими задумками. Если нужно просто управлять мотором (включени/выключение, реверс, скорость вращения, нагрузка на двигатель), то вполне можно реализовать на микрочиповском PIC18F4550. Из обвязки кварц на 20 мегагерц, 1 резистор и 3 конденсатора. Платка уместится под ногами у проца, если это DIP, если TQFP - то на обратной стороне.
Итого. Никого ни к чему не собираюсь призывать, ибо неблагоданое сие есть занятие

Могу лишь дать некоторые практические рекомендации. И поделиться готовыми наработками, если кого заинтересует.
Зы.Сы. Делал на этом девайсе некий аналог USB-осциллографа. Фиговый, надо сказать,вышел осциллограф, потому как программер я фиговый

Но для моих целей он вполне подошел. Делал еще девайс для управления нагрузкой - управляет. Сча вот обдумываю CNC на его базе, тока не приду к выводу, а надо ли оно мне?

В общем, дерзайте, и все у Вас получится
