Поставь примерно по 1000мкФ на канал, а лчше по2 конденсатора на 470мкФ на канал.

А диоды параллельно двигателю, надеюсь, установлены? Без этих диодов нормальной работы не будет.

А зачем на канал? Все равно питание соединено, почему бы один общий конденсатор скажем на 22.000 мкф не поставить,
параллельно питанию авто?

- Да, конечно, как на схеме...

На всякий случай, вот схемы всей проводки:
www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.1.JPG
www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.2.JPG
www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.3.JPG
www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.4.JPG
www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.5.JPG
www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.6.JPG

Не заметил.Потому, что много мелких в данном случае лучше, чем один большой. И ставить его нужно непосредственно на плату.

Вообщем конденсатор ни на 4700 мк, ни на 22000 мк параллельно питанию ШИМ-регулятора,
не решил проблему.. Помехи в бортсеть, которые отрубают реле зарядки, идут даже
от ШИМ-регулятора который питает просто лампочки...

Нагрузка по какой схеме подсоединена? Есть схема 3х проводная есть 4х.

Вот общая схема: http://www.tis.kz/uaz/engine_v.3.4-p.6.JPG

Масса везде общая, еще на плате, а от платы уже четырьмя проводами идет на общую шину массы..

При подключении первого бензонасоса к контактам 005 и 007 идет помеха отрубающая реле зарядки,
так-же при подключении второго бензонасоса к контактам 008 и 010 идет помеха отрубающая реле зарядки.
Переменные резисторы бензонасосов распаяны на плате.

При подключении ламп к контактам 011 и 014 так-же идет помеха отрубающая реле зарядки.
Переменный резистор ламп внешний.

Конденсаторы подключались к контактам 006 и 007, 008 и 009, 011 и 012

Если реле регулятор не встроенный то его можно питать через LC фильтр.

Реле-регулятор не встроенный, но это не выход, каждое эл.устройство в машине питать отдельным фильтром...

По приведенной вами схеме, по второму варианту (который не перечеркнут крестиком),
нет возможности подключить нагрузку..

Возможно только + конденсатора подключить напрямую на + нагрузки, и - конденсатора на массу..

Ищите свой выход тогда. Попробуйте поставить реле другого производителя.

Я вижу только один выход - ШИМ очень не стабильное и не надежное устройство для ограничения и регулирования
мощности, которое создает кучу проблем на остальное электронное оборудование. Посему придется пробовать
перейти на линейный регулятор мощности, в моем случае просто убрать таймер NE555 и замкнуть 5 и 3 контакты в его колодке..

Ну или искать другую схему ШИМ-контроллера, которая не будет создавать помехи в сети.

Может сделать более устойчивый реле регулятор, это проще.
помехи от ШИМа не зависят от микросхемы, в основном зависит от разводки проводов.
Можно конечно на выходе каждого ШИМа поставить дроссель и конденсатор, но дроссели на такой ток будут гораздо больше фильтра для реле регулятора.
Можно и линейный сделать, он будет полезен особенно зимой. Правда габариты будут достаточно большие.

Запитайте тогда плату ШИМ-регулятора через дроссель, должно помочь, вам же предлагали уже ...

Если питать плату через дроссель, как его рассчитать? После дросселя ставить в параллель электролит и керамику?