тут собрал программатор stk200 и мне надо прошить megy16 через avrdude, а как это сделать не знаю, через cvavr и icprog не получается.

а в чем именно проблема? avrdude поддерживает STK200 и вообще его можно настроить чуть ли не на любой программатор... я вот на свой адаптер его настроил за 15 минут изучения его конфигурационного файла...

д и ежу понятно что он с стк работает. я незнаю какие команды настройки ему посылать

а ежу не понятно, что документацию надо читать?
всех делов-то - указать тип программатора в командной строке: -cstk200. avrdude поддерживает несколько вариантов клонов STK200, так что определитесь со схемой своего варианта и соответственно укажите в командной строке: -cpony-stk200 если у вас ponyprog-вариант STK200. а если у вас какой-то нестандартный клон - сделайте конфиг для него сами