1. Частоту среза фильтра вы можете делать сколь угодно низкую, зачем делать её на 62 кГц, а тем более на 626 кГц? Делайте его хоть сразу на сто герц. Ну да, дроссель здоровый будет.

2. Обязательно проверьте АЧХ фильтра. Возможно, он не столь эффективен, как вам хочется, из-за паразитных параметров - той же межобмоточной ёмкости дросселей.

3. Я бы делал двойной П-контур, у которого параллельно одной из катушек включён конденсатор, образуя параллельный контур на частоту помехи.

2. Найти генератр синуса с частотами до мегагерца, а то и побольше. Звуковуха компа тут не годится. Подключить к генератору вход фильтра, на выход фильтра подключить нагрузочный резистор (такой, чтобы генератор не спалить) осциллограф или вольтметр. Установить частоту, измерить напряжения на входе и выходе фильтра, найти их соотношение, перевести в децибелы, записать в таблицу. Пройтись по диапазону от частоты среза до мегагерца, то есть выше вашей проблемной частоты... а то даже и её гармоник. Построить по точкам АЧХ, частоту откладывть в логарифмическом масштабе.

Кстати, выбирая фильтр или дроссель для него, всегда помните, что при насыщении индуктивность падает и фильтр может напрочь перестать работать. Поэтому сердечник не должен насыщаться при ваших токах потребления.

Ну, значит, все проблемы ещё впереди. Обратите внимание на прошлое моё сообщение, я его дописал - имеется в виду зазор в магнитопроводе.