Как вариант опции "clock sourse" и "timer1 clock" должны соответствовать исходному проекту. Возможно еще с функциями millis/micros - установить запрет на них.
Опционные вкладки в окошке платформы "фузозависимые"...
А вот чтобы поменялись фузы, в соответствии с заданными с помощью опций значениями, надо через программатор (тот же ардуиноISP к примеру) выполнить операцию "записать загрузчик".
После того комплект фуз установится в соответствии с выбранной конфигурацией (в том числе и при опциях "no bootloader").
Дальше работаем в обычном режиме - загрузка или через программатор (при опциях "no bootloader") или по стандартному СОМ (Rx/Tx).

Есть еще платформа DIYattiny - там несколько иной набор опций...
Код:
https://raw.githubusercontent.com/sleemanj/optiboot/master/dists/package_gogo_diy_attiny_index.json
