Ну вы хоть внимательней почитайте, что сами пишите:
ttyUSB0 - так определяются программаторы на FT232 и подобные.
Пропишите в настройках дудки ttyACM0, протокол AVR910 и всё.Программатор определился как
crw-rw---- 1 root dialout 166, 0 2013-04-19 10:13 ttyACM0
can't open device "/dev/ttyUSB0"
ttyUSB0 - так определяются программаторы на FT232 и подобные.