а по делу - это похоже на резонанс напр через балластные rc. поднялась добротность после перемотки.
я бы убедился в целостности балластной цепи первички и если она ок - просто переставить балласт на катоды выпрямительных диодов , прямо обе параллельно на землю. забрав их с вторичной обмотки . ну или сопротивления увеличить и их мощность, но это колхоз имхо.
ты же групповой дроссель оставил? у того что потом - индуктивность совсем маленькая, лучше оставить групповой и даж соединить последовательно две обмотки что потолще. на моей картинке это и балластная цепь не изображены, но это плохое упрощение если в реале повторять)). вот как тут:



