Инструкция как этим пользоваться тут http://easyelectronics.ru/sinaprog-graf ... rdude.html
Но stk500 - программатор фирменный, может даже лучше будет прямо из avr студии на микроконтроллер программу заливать, там же и фузы.
http://www.atmel.com/Images/doc1925.pdf
Про make и Makefile много где можно почитать, например тут http://habrahabr.ru/post/155201/
PS. Вы еще спрашивали,
Скачайте AVR Studio 4 для работы. В более поздних версиях Atmel-овцы добавили туда поддержку ARM, насколько я знаю, и переименовали студию в Atmel Studio. Кстати, кто знает, поправьте меня - в новых студиях они свой Си-компилятор чтоли запилили?"AVR Studio" и "Atmel Studio" это одно и тоже?
У меня проект из самой статьи успешно определился и собрался в четвертой студии, просто кликните на aps-файл и студия откроет весь проект. Режим (MODE) в этой версии проекта устанавливается в единственном файле Makefile
Код: Выделить всё
# Place -D or -U options here
# для mo (моно 8 бит) -DMODE=0
# для st (стерео 8 бит) -DMODE=1
# для hf (моно 16 бит) -DMODE=2
CDEFS = -DF_CPU=$(F_CPU)UL -DMODE=2
only pure true norwegian blackx 


