Потом выставил фьюзы на тактирование от внешнего источника 3-8Mhz (на плате стоит кварц 7,3Mhz с 22пф конденсаторами).
И все. ATmega128 стал невидимым для программатора.
Раньше со 128 никогда не работал - пользовался DIP'ами atmega16, atmega 64 итд. Они успешно тактировались при прошивки от кварца.
Может 128 не тактируется от кварца и ему нужен программаторский источник тактирования на ногу XTAL1?
Смутил даташит - там оно так и нарисовано:

P.S. прошил только фьюзы, программу не заливал, там он пустой. может еще от этого он не может завестись?



