У этого МК всего 1 АЦП, а под (внешним) каналом подразумевается истоник сигнала на одном из 16 аналоговых входах корпуса. Каналы могут обслуживаться только последовательно. Т.е для для оцифровки сигналов от всех 16 каналов потребуется 1 мкс для каждого, т.е. всего 16 мкс. При этом частота опроса единичного канала в серии из 16, как и всей серии, будет равна 1/16 мгц.
Конечно можно. У АЦП несколько режимов работы, включая единичное преобразование с одного канала, последовательное преобразование от серии каналов, и т.д. ДШ читали (Reference Manual)? Там все подробно написано.