и трансформатор по питанию
Для сделанного на коленке лучший выбор - батареи. Обычные трансформаторы, опять же, никто не сертифицирует для медицинских применений. И непонятно, какая там емкостная утечка. Да-да, между обмотками есть ощутимая емкость и здесь это тоже надо учитывать.
Но всеравно не откажусь от доступных деталей, в пользу понтовых ..фильских.
Не путайте понты и сертификацию по надежности. Помните спутник ГЛОНАСС, который успешно вывели на подводную орбиту? Вот там тоже решили не отказываться от доступных деталей в пользу сертифицированных. Сэкономили, да.
Только если спутник упал в океан, это, в общем, обидно, но не так не страшно.
В цифровой никак не получится, микроконтроллер не разрежешь, а внешний ацп это уж слишком, шину юсб не порвешь тоже.
У Вас USB прям в МК втыкается? Я бы разорвал UART. Т.е., МК -> UART с опторазвязкой -> USB-COM преобразователь -> ПК.