Для работы с внутренним генератором (по умолчанию от производителя) тот внешний кварц не мешает. Стоят себе впаяные и ладно.
Режимы с внешним тактированием и внешним R-C генератором штука весьма редко в радиолюбительских конструкциях встречаемая.
Отлаживать в железе программы для МК, удобней на отладочной плате, где имеется достаточно периферии (в том числе и кварцы). Её можно изготовить по своим потребностям или купить уже готовую. Мой вариант выглядит так и вполне меня устаивает.