Подключаете последовательно с мотором, и меряете напряжение на моторе, чем больше ёмкость, тем выше напряжение.. Даже если вы ошибётесь, и напряжение будет заметно выше, чем нужно, мотор всё равно "моментально" не сгорит, сначала он будет долго греться, "жаловаться" и гудеть, и только потом, если вы его жалоб не заметите- пустит "дымок"..
А вообще мотор от ЭПУ слишком слаб для этой задачи..